Каменная церковь с такой же колокольней построена в 1770 г. попечением секунд-майора Андрея Иродионовича Кошелева и его супруги Анны Васильевны. Главный престол освящен в честь иконы Пресвятой Богородицы «Знамение», в теплой трапезной правый придел освящен во имя святителя Николая, левый — во имя святителя Алексия, Митрополита Московского.

3 июня 1858 г. в Московская Духовная Консистория приняла решение «о распространении Знаменской в селе Знаменском Лисинцеве тож церкви». При этом упоминалось, что «существующая церковь будет совершенно разобрана и возведена новая».

Новая Знаменская церковь была построена в 1863 г. тщанием прихожан и московских купцов Иоанна и Павла Жилиных. Трапезная с приделами того же наименования также построена иждивением прихожан. К храму была приписана церковь во имя Иоанна Богослова в селе Жедочи (построена в 1716 г.). Церковная школа помещалась в доме графа Шереметева.

В Знаменской церкви совершали служение иеромонах Гавриил (Гур), и диакон Николай Запольский. Преподобномученик Гавриил был арестован и расстрелян в 1937 г. на полигоне Бутово. Священномученика Николая расстреляли в 1938 г. и погребли в общей безвестной могиле там же.

Знаменскую церковь взорвали. Камень разрушенного храма использовали для строительства дороги. Исчезла усадьба, обезлюдело село.

Силами общины храма преподобного Серафима Саровского в поселке Селятино на месте разрушенного храма 19 ноября 2002 г. установлен и освящен памятный поклонный крест и мраморная плита.

В рамках реализации областной программы «Восстановим порушенные святыни» 16 ноября 2015 года в деревне Лисинцево состоялась торжественная церемония закладки под строительство церкви Знамения Пресвятой Богородицы в деревне Лисинцево и освящения первого камня.

А в 2016 году прошло заседание комиссии общественной палаты Московской области, на котором принято решение по восстановлению архитектурного облика Лисинцево как единого объекта культурного наследия.

Это предполагает создание историко-культурного комплекса «Музея под открытым небом «Лисинцево – Знаменское» , включающее в себя :

• строительство церкви Знамения Пресвятой Богородицы ,
• благоустройство липового парка усадьбы Глебовых- садово-паркового ансамбля , созданного в конце 18 века, площадью 1.6 га и липового парка (120 х 100 метров) в нем,
• восстановление искусственных каскадных прудов,
• создание пешеходной прогулочной зоны вдоль реки– тропы «Добродетелей»;
• благоустройство родника «Знаменский»,
• Создание открытого музея на месте старинного погоста.